一、質(zhì)粒構(gòu)建原理
在堿性條件下,染色體DNA和質(zhì)粒DNA都發(fā)生變性,但質(zhì)粒DNA的**螺旋共價閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的兩條互補(bǔ)鏈不會*分離,當(dāng)用酸性的高鹽緩沖液將pH中和至中性時,變性的質(zhì)粒DNA又恢復(fù)到原來的構(gòu)型并溶解在溶液中,而染色體DNA不能復(fù)性而形成纏連的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。通過離心,纏結(jié)的染色體DNA與不穩(wěn)定的大分子RNA、蛋白質(zhì)—SDS復(fù)合物等一起沉淀下來而被除去。上清液中的質(zhì)粒DNA因不溶于70%的乙醇,可在加入乙醇后通過離心得到質(zhì)粒DNA沉淀。
二、質(zhì)粒構(gòu)建試劑
1、LB培養(yǎng)基
蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl10g加重蒸水950ml,待*溶解后,用1N NaOH調(diào)pH至7.0,補(bǔ)加重蒸水至總體積1000ml,151bf/in2高壓蒸氣滅菌20分鐘。
2、氨芐青霉素:100mg/ml
3、溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖;25mmol/L Tris—HCl(pH8.0);10mmol/L EDAT(pH8.0)
4、溶液Ⅱ(臨用時配):0.2mol/L NaOH,1%SDS
5、溶液Ⅲ:0.5mol/L乙酸鉀60ml;冰乙酸11.5ml;H2O28.5ml
6、酚-氯仿:將酚和氯仿等體積混合后用0.1mol/L Tris-HCl (pH7.6)抽提幾次以平衡這一混合物,置棕色玻璃瓶中,上面覆蓋0.01mol/L Tris-HCl (pH7.6)液層,4℃保存。
7、氯仿-異戊醇:將氯仿和異戊醇按24:1的比例混合。
8、TE緩沖液(pH8.0):10mol/L Tris-HCl(pH8.0);1mmol/L EDAT
9、RNase 1mg/ml:稱10mg RNase于Eppendorf管中,溶于1ml 10mmol/L Tris-HCl(pH7.5)、15mmol/L NaCl溶液中,于100℃加熱15分鐘,緩慢冷卻至室溫,此液為10mg/ml RNase濃度,應(yīng)用時稀釋至1mg/ml。
10、70%乙醇、無水乙醇
三、質(zhì)粒構(gòu)建操作
1、將含有pBS-SK質(zhì)粒的大腸桿菌XL1-blue 10μl接種到10ml含氨芐青霉素(100μg /ml)的LB培養(yǎng)液中,37℃振搖過液。
2、取1.5ml菌液轉(zhuǎn)入Eppendorf管中,5000rpm離心1分鐘,吸凈上清。
3、將細(xì)菌沉淀重懸于100μl用冰預(yù)冷的溶液Ⅰ中,劇烈振蕩。
4、加200μl新配制的溶液Ⅱ,蓋緊管口,輕緩顛倒Eppendorf管5次,以混合內(nèi)容物,禁止劇烈振蕩。置冰浴中放置5分鐘。
5、加150μl用冰預(yù)冷的溶液Ⅲ,蓋緊管口,反復(fù)顛倒數(shù)次,使溶液Ⅲ在粘稠的細(xì)菌裂解物中分散均勻,隨后置冰浴中5分鐘。
6、用微量臺式高速離心機(jī)12000rpm 離心5分鐘,將上清轉(zhuǎn)入另一Eppendorf管中。
7、加等體積酚-氯仿,劇烈振蕩1分鐘后,12000rpm離心5分鐘,將上層液轉(zhuǎn)入另一Eppendorf管中。
8、加等體積氯仿-異戊醇,劇烈振蕩10秒鐘后,短暫離心12000rpm1分鐘,將上層液轉(zhuǎn)入另一Eppendorf管中。
9、室溫下加2倍體積的無水乙醇,振蕩混合,室溫下靜置5分鐘。
10、12000rpm離心5分鐘,去上清液,加1ml 70%乙醇,短暫振搖,然后再離心(12000rpm
分鐘)。
11、除去所有上清液,待待殘余乙醇揮發(fā)干凈后,加30μlTE緩沖液(pH8.0)溶解沉淀,加1μl RNase (1mg/ml),37℃保溫15分鐘,取出后即可用于酶切分析或置-20℃保存?zhèn)溆谩?/span>
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詞條說明
一、質(zhì)粒構(gòu)建原理 在堿性條件下,染色體DNA和質(zhì)粒DNA都發(fā)生變性,但質(zhì)粒DNA的**螺旋共價閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu)的兩條互補(bǔ)鏈不會*分離,當(dāng)用酸性的高鹽緩沖液將pH中和至中性時,變性的質(zhì)粒DNA又恢復(fù)到原來的構(gòu)型并溶解在溶液中,而染色體DNA不能復(fù)性而形成纏連的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。通過離心,纏結(jié)的染色體DNA與不穩(wěn)定的大分子RNA、蛋白質(zhì)—SDS復(fù)合物等一起沉淀下來而被除去。上清液中的質(zhì)粒DNA因不溶于70%的乙
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